Struktura destilacijskega stroja vključuje predvsem naslednje ključne dele:
Molekularni uparjalnik: To je temeljni del molekularne destilacijske naprave, ki je odgovoren za ogrevanje materiala in izhlapevanje . Material je enakomerno porazdeljen na ogrevalni površini skozi distributer tekočine na rotorju, da tvori izjemno tanek folid s turbulentnim filmom {{1} { Molekule se kondenzirajo v tekočino na kondenzatorju, težke molekule pa se zbirajo skozi krožni kanal pod ogrevalno površino .
Sistem za razpadanje: Uporablja se za odstranjevanje plina iz materiala, da se zagotovi nemoten napredek postopka destilacije .
Sistem za hranjenje: odgovoren za dodajanje materialov v opremo za destilacijo .
Ogrevalni sistem: zagotavlja potrebno toploto, da material doseže temperaturo izhlapevanja .
Hladilni vakuumski sistem: Zagotovite delovanje pod visokim vakuumskim okoljem, tako da je srednja prosta pot molekul hlapov večja od razdalje med izhlapevalnim površino in kondenzacijsko površino, s čimer učinkovito loči tekočo mešanico .
Krmilni sistem: Uporablja se za spremljanje in nadzor celotnega postopka destilacije, da se zagotovi, da vsi deli delujejo skupaj .
Kondenzator: kondenzira molekule izhlapene svetlobe v tekočino, jih zbira in izpusti .
Decharge Pipe: Uporablja se za praznjenje svetlobnih molekul in težkih molekul ter zbira izdelke ločeno .

